Análisis y caracterización de la unión de la proteína humana HMGB1 a distintos lncRNAs asociados a cáncer de ovario

Abstract

[Resumen]: El cáncer de ovario presenta una tasa relativa de supervivencia a 5 años de sólo el 30-40% como consecuencia de su detección tardía. El diagnóstico en etapas tempranas eleva la tasa de supervivencia hasta más del 90%. Por ello, desarrollar nuevas herramientas de detección precoz supone un reto primordial y, con esta motivación, se investigan interacciones HMGB1-lncRNAs que puedan ser útiles como biomarcadores. HMGB1 es una proteína que se ha asociado repetidamente con varios tipos de cáncer, incluido el de ovario. Los lncRNAs, transcritos no codificantes de proteínas de más de 200 nucleótidos con la capacidad de regular la expresión génica a distintos niveles, se han visto desregulados en células tumorales ováricas. Esto, junto con su especificidad de tejido y etapa de desarrollo y la posibilidad de detectarse en fluidos corporales, los convierte en buenos candidatos como nueva clase de biomarcadores. Además, la estabilidad de los lncRNAs aumenta cuando forman complejos con proteínas. En el presente trabajo, se realiza una primera aproximación experimental a la capacidad de unión de HMGB1 al lncRNA BGas in vitro mediante las técnicas Ensayo de cambio de movilidad electroforética (EMSA, del inglés Electrophoretic Movility shift Assay) y Anisotropía de fluorescencia (FA, del inglés Fluorescence Anisotropy).

[Abstract]: Ovarian cancer has a 5-year survival rate of only 30-40% as a consequence of late detection. Early diagnosis raises the survival rate to more than 90%. Therefore, developing new tools for early detection is a major challenge and, with this motivation, HMGB1-lncRNAs interactions that may be useful as biomarkers are investigated. HMGB1 is a protein that has been repeatedly associated with several types of cancer, including ovarian cancer. LncRNAs, non-coding transcripts of proteins of more than 200 nucleotides with the ability to regulate gene expression at different levels, are deregulated in ovarian tumor cells. This, together with their tissue and developmental stage specificity and the possibility of being detected in body fluids, makes them good candidates as a new class of biomarkers. In addition, the stability of lncRNAs increases when form complexes with proteins. In the present work, a first experimental approach to the binding capacity of HMGB1 to BGas lncRNA in vitro is performed using the Electrophoretic Mobility shift Assay (EMSA) and Fluorescence Anisotropy (FA) techniques.