Análisis proteómico de líquido sinovial para la búsqueda de biomarcadores de severidad en la artrosis

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http://hdl.handle.net/2183/29204Coleccións
- Traballos académicos (FCIE) [1006]
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Análisis proteómico de líquido sinovial para la búsqueda de biomarcadores de severidad en la artrosisTítulo(s) alternativo(s)
Proteomic analysis in synovial liquid to search for severity biomarkers in osteoarthrosisAnálise proteómica do fluído sinovial para búsqueda de biomarcadores de gravedade na artrose
Autor(es)
Director(es)
Blanco García, Francisco JFernández-Puente, Patricia
Data
2021Centro/Dpto/Entidade
Universidade da Coruña. Facultade de CienciasDescrición
Traballo fin de mestrado (UDC.CIE). Bioloxía molecular, celular e xenética. Curso 2020/2021Resumo
[Resumen]: La osteoartritis (OA) es caracterizada por la degradación progresiva del cartílago articular, cambios en el hueso subcondral acompañados de una alteración en la membrana sinovial; involucra las articulaciones móviles el cual limita la movilidad de ellas. Se reconoce como una enfermedad multifactorial donde distintas causas son capaces de generar y perpetuar el daño sobre el cartílago articular. Una de las limitaciones que presenta el diagnóstico de OA es que se realiza cuando el paciente tiene un daño articular considerable. Como resultado de dicha degradación se liberan fragmentos de estas macromoléculas al líquido sinovial. La determinación de los niveles de estos fragmentos, llamados biomarcadores, podría ser útil con objeto de estandarizar su empleo como procedimiento diagnóstico y pronóstico en la enfermedad degenerativa articular. El uso de biomarcadores como diagnóstico temprano de la enfermedad, sería de gran importancia por su abordaje en la enfermedad antes del comienzo de la sintomatología, evaluación de la progresión y pronóstico. Los biomarcadores se pueden obtener de fluidos corporales en cualquier etapa de la enfermedad para su estudio. Una caracterización molecular detallada del líquido sinovial podría identificar proteínas asociadas con la patogénesis, que se pueden desarrollar como biomarcadores para la evaluación de la enfermedad en etapas tempranas y su progresión. La aplicación de técnicas proteómicas para la búsqueda de nuevos biomarcadores pretende generar información de valor clínico acerca de la susceptibilidad, diagnóstico, pronóstico y terapia. La búsqueda e identificación de los biomarcadores en este trabajo se realiza en base a metodologías proteómicas por medio de espectrometría de masas. Se analizaron 20 muestras de pacientes diagnosticados con OA y un grupo control de líquido sinovial realizando un análisis proteómico utilizando cromatografía liquida acoplada a un espectrómetro de masas de alta resolución timsTOF Pro para la identificación y cuantificación de proteínas. Para el análisis de los datos se ha usado el software PEAKS. Se han identificado aproximadamente un total de 765 proteínas totales y un total de 585 grupo de proteínas. Se cuantificaron 12 proteínas en las muestras de líquido sinovial comparando los grados de OA con controles sanos utilizando un test de ANOVA (p<0.05). Se han encontrado 3 proteínas las cuales fueron comparadas con estudios previos para analizar su comportamiento como posibles biomarcadores en OA. [Abstract]: Osteoarthritis (OA) is characterized by the progressive degradation of articular cartilage,
changes in the subchondral bone accompanied by an alteration in the synovial membrane; it
involves the mobile joints, which limits their mobility. It is recognized as a multifactorial
disease where different causes are capable of generating and perpetuating damage to the
articular cartilage. One of the limitations with the diagnosis of OA, is that it is performed when
the patient has considerable joint damage. The result of the degradation releases fragments of
macromolecules to the synovial fluid. The determination of the levels of these fragments, called
biomarkers, could be useful in order to standardize their use as a OA diagnostic and prognostic
procedure in degenerative joint disease.
The use of biomarkers as an early diagnosis of the disease would be as an important due to its
approach to the disease before the onset of symptoms, progression and prognosis. Biomarkers
can be obtained for their study from body fluids at any stage of the disease. The application of
proteomic techniques to search for new biomarkers aims to generate information of clinical
value about susceptibility, diagnosis, prognosis and therapy.
In this study the search and identification of biomarkers is carried based on proteomic
methodologies by means of mass spectrometry. 20 samples of synovial fluid from patients
diagnosed with OA and a control group were analyzed performing a proteomic analysis using
liquid chromatography coupled to a timsTOF Pro high-resolution mass spectrometer for the
identification and quantification of proteins. For data analysis, PEAKS software has been used,
approximately a total of 765 total proteins and a total of 585 group of proteins have been
identified. Twelve proteins were quantified in the synovial fluid samples comparing the degrees
of OA with healthy controls using an ANOVA test (p <0.05). Three proteins have been found
as possible biomarkers in OA which were compared with previous studies to analyze their role
and behavior in the disease. [Resumo]: A osteoartrose (OA) está caracterizada pola degradación progresiva da cartilaxe articular,
cambios no oso subcondral acompañados dunha alteración na membrana sinovial; involucra as
articulacións móviles, limitando a movilidade das mesmas. É unha enfermidade multifactorial
onde distintas causas son capaces de xerar e perpetuar o dano sobre a cartilaxe articular. Unha
das limitacións que presenta a OA co diagnóstico é que realízase cando o paciente ten un dano
articular considerable. O resultado de dita degradación é a liberación de fragmentos de
macromoléculas ó líquido sinovial. A determinación dos niveis destos fragmentos, chamados
biomarcadores, podría ser útil co obxeto de estandarizar o seu emprego como procedemento
diagnóstico e pronóstico nesta enfermidade articular.
O uso de biomarcadores como diagnóstico temprá da enfermidade sería de gran importancia
pola sua abordaxe na enfermidade, antes do comezo da sintomatoloxía, evaluación da
progresión e pronóstico. Os biomarcadores pódense obter dos fluidos corporais en cualquera
etapa da enfermidade para o seu estudio. A búsqueda e identificación dos biomarcadores neste
traballo realizouse en base a metodoloxías proteómicas por medio da espectrometría de masas.
A aplicación de técnicas proteómicas para a búsqueda de novos biomarcadores pretende xerar
información de valor clínico acerca da susceptibilidade, diagnóstico, pronóstico e terapia.
Neste traballo analizáronse 20 mostras de pacientes diagnosticados con OA e un grupo control
de líquido sinovial, realizando unha análise proteómica en cromatografía líquida acoplada a un
espectrómetro de masas de alta resolución timsTOF Pro, para a identificación e cuantificación
de proteínas. Para a análise dos datos empregouse o software PEAKS, identificáronse un total
de 765 proteínas totais e un total de 585 grupos de proteínas. Cuantificáronse 12 proteínas
empregando un test de ANOVA (p<0.05) nas mostras de líquido sinovial comparando os
grados de OA con controis sanos. Encontráronse 3 proteínas, as cales foron comparadas con
estudios previos para analizar o papel como posibles biomarcadores na OA.
Palabras chave
Sinovia
Análisis
Artrosis
Diagnóstico precoz
Marcadores biológicos
Cromatografía en fase líquida acoplada a la espectrometría de masa
Proteómica
Métodos
Proteínas
Análisis
Expresión genética
Análisis
Artrosis
Diagnóstico precoz
Marcadores biológicos
Cromatografía en fase líquida acoplada a la espectrometría de masa
Proteómica
Métodos
Proteínas
Análisis
Expresión genética
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