Siderophores from Pathogenic Bacteria and Bioactive Peptides for the Development of New Antimicrobial and Antitumor Strategies

Abstract

[Resumen] Actualmente, el diseño y desarrollo de nuevos tratamientos contra el cáncer e infecciones bacterianas resistentes a antibióticos es uno de los mayores retos científicos. En este contexto, esta tesis doctoral pretende sentar las bases para el desarrollo de nuevas estrategias antimicrobianas y antitumorales basadas en los mecanismos de adquisición de hierro usados por las bacterias patógenas, y en el diseño y modificación racional de péptidos bioactivos. El capítulo 1 comienza con una discusión sobre la importancia de los mecanismos de captación de hierro mediados por sideróforos, profundizando en su relevancia para el desarrollo de nuevas estrategias antimicrobianas. A continuación, se discuten detalladamente cuatros estudios enfocados en el aislamiento e identificación de los sideróforos, así como de los genes implicados en su utilización, de bacterias patógenas en humanos (Acientobacter baumannii) y en peces de acuicultura (Vibrio neptunius, Tenacibaculum maritimum y Vibrio anguillarum). Estos estudios buscan profundizar en el conocimiento de los factores de virulencia de dichas bacterias y en la descripción de nuevas dianas terapéuticas. El capítulo 2 comienza con una introducción sobre las características de los péptidos antimicrobianos y péptidos penetrantes en células y su interés en el desarrollo de nuevas terapias antimicrobianas y antitumorales. A continuación, se describen dos proyectos de investigación, llevados a cabo durante una estancia de investigación en la Universidad de Pensilvania (UPenn), centrados en el diseño racional y evaluación biológica de nuevos péptidos antimicrobianos basados en péptidos activos encontrados en distintos venenos. Por último, se discute un estudio llevado a cabo en colaboración con la Universiti Teknologi MARA (Malasia) en el que se modificó un péptido activo para aumentar su capacidad de permeabilizar la membrana de células cancerígenas e introducir compuestos activos mediante una estrategia caballo de Troya.

[Resumo] Actualmente, o deseño e desenvolvemento de novos tratamentos eficientes contra o cancro e a resistencia antimicrobiana é un dos maiores retos científicos.Neste contexto, esta tese doutoral pretende afondar e sentar as bases para o desenvolvemento de novas estratexias antimicrobianas e antitumorais baseadas nos mecanismos de captación de ferro (III) empregados por bacterias patóxenas, eo deseño racional de novos péptidos bioactivos. O capítulo 1 comeza cunha discusión sobre a importancia dos mecanismos decaptación de ferro mediados por sideróforos nas bacterias patóxenas, afondando na relevancia destes mecanismos no desenvolvemento de novas estratexias antimicrobianas. A continuación, descríbense detalladamente catro estudios enfocados no illamento e identificación dos sideróforos, así como os xenes involucrados no seu emprego, de bacterias patóxenas críticas en humanos (Acinetobacter baumannii) e en peces de acuicultura (Vibrio neptunius, Tenacibaculum maritimum y Vibrio anguillarum). Estes estudos permitiron obter unha visión máis completa dos factores de virulencia de ditas bacterias e resultou na descrición de novas posibles dianas terapéuticas. O capítulo 2 comeza cunha introdución sobre as características dos péptidos antimicrobianos e péptidos penetrantes en células, e exponse o seu interese para o desenvolvemento de novas terapias antimicrobianas e antitumorais. A continuación, descríbense dous proxectos de investigación, levados a cabo durante unha estadía na Universidade de Pensilvania (UPenn), centrados no deseño racional e avaliación biolóxica de novos péptidos baseados en modelos atopados en distintos velenos. Por último, discútese un estudio levado a cabo en colaboración coa Universiti Teknologi MARA (Malasia) no que se modifica un péptidos activo para aumentar a súa capacidade para permeabilizar a membrana de células canceríxenas e introducir compostos activos mediante unha estratexia cabalo de Troia.

[Abstract] Currently, the design and development of novel and efficient treatments against cancer and antimicrobial resistant infections is one of the major scientific challenges. In this context, this thesis dissertation aims to set the basis for the development of new antimicrobial and antitumor strategies based on the iron (III) uptake mechanisms employed by pathogenic bacteria, as well as the rational design of bioactive peptides. In chapter 1 the relevance of the siderophore-mediated iron uptake mechanisms utilized by pathogenic bacteria is discussed, highlighting their relevance in the development of novel antimicrobial strategies. Subsequently, the isolation and identification of the siderophores, along with the description of their associated genes, from four critical pathogens affecting humans (Acinetobacter baumannii) and fish from aquaculture (Vibrio neptunius, Tenacibaculum maritimum, and Vibrio anguillarum) are carefully described. The primary goal of these studies was to provide an extensive understanding of the virulence factors associated with these bacteria and to delineate potential novel therapeutic targets. In Chapter 2 a comprehensive introduction about the main features of antimicrobial and cell-penetrating peptides and their promising role in the development of novel antimicrobial and antitumor therapies is provided. Subsequently, two research projects, conducted during a research stay at the University of Pennsylvania (UPenn), are detailed. These studies were focused on the rational design and biological evaluation of new antimicrobial peptides based on natural scaffolds found in various venoms. Finally, a collaborative study with Universiti Teknologi MARA (Malaysia) is discussed. In this study, a homing peptide was rationally modified to enhance its capacity to permeabilize the membrane of cancer cells and potentially introduce active cargoes through a Trojan horse strategy.