Tráfico de ADN entre o xenoma mitocondrial e o nuclear: Estudo das insercións de NUMTs no xenoma secuenciado de Podarcis muralis

Abstract

[Resumo] O tráfico continuo de ADN entre a mitocondria e o núcleo é unidireccional e xera numerosas copias nucleares de xenes mitocondriais (NUMTs) con discutida relevancia evolutiva. A día de hoxe existen moitas incógnitas rodeando estas secuencias, dende os procesos que as orixinan ate o xeito no que se comportan. Neste traballo realizamos numerosos aliñamentos empregando o xenoma secuenciado de Podarcis muralis para estudarmos a fondo estes elementos, analizando a súa importancia nos procesos evolutivos, así como a predominancia dalgunhas rexións da mitocondria nos cromosomas e discutimos a súa utilidade á hora de caracterizar elementos transpoñibles. Atopáronse un total de 23 NUMTs cun tamaño promedio de 783pb localizando o 95% destes en rexións non codificantes. Aproximadamente un 82% do xenoma mitocondrial está representado nos NUMTs, exhibindo un marcado nesgo na orixe destas insercións, con case a metade provindo da rexión de control.

[Resumen] El tráfico continuo de ADN entre la mitocondria y el núcleo es unidireccional y genera numerosas copias nucleares de genes mitocondriales (NUMTs) con discutida relevancia evolutiva. A día de hoy existen muchas incógnitas rodeando estas secuencias, desde los procesos que las originan hasta la manera en la que se comportan. En este trabajo realizamos numerosos alineamientos empleando el genoma secuenciado de Podarcis muralis para estudiar a fondo estes elementos, analizando su importancia en los procesos evolutivos, así como la predominancia de algunas regiones de la mitocondria en los cromosomas y discutimos su utilidad a la hora de caracterizar elementos transponibles. Un total de 23 NUMTs fueron encontrados, con un tamaño promedio de 783pb localizando el 95% de estes en regiones no codificantes. Aproximadamente un 82% del genoma mitocondrial está representado en los NUMTs, exhibiendo un marcado sesgo en el origen de estas inserciones, con casi la mitad proviniendo de la región de control.

[Abstract] The continuous DNA traffic between mitochondria and the nucleus is unidirectional and generates numerous nuclear copies of mitochondrial genes (NUMTs) with controversial evolutionary relevance. To date there are many unknowns surrounding these sequences, from the processes that give rise to them to the way in which they behave. In this work we performed numerous alignments using the sequenced genome of Podarcis muralis to study these elements in depth, analyzing their importance in evolutionary processes, as well as the predominance of some mitochondrial regions in chromosomes and discuss their usefulness in characterizing transposable elements. A total of 23 NUMTs were found, with an average size of 783 bpb, 95% of which were located in non-coding regions. Approximately 82% of the mitochondrial genome is represented in the NUMTs, exhibiting a marked bias in the origin of these insertions, with almost half coming from the control region.