Análisis de la estructura genética de una población de Iberolacerta monticola usando polimorfismos de nucleótido único (SNPs) en marcadores distribuidos por todo el genoma

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http://hdl.handle.net/2183/28879Collections
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Análisis de la estructura genética de una población de Iberolacerta monticola usando polimorfismos de nucleótido único (SNPs) en marcadores distribuidos por todo el genomaAuthor(s)
Directors
Naveira, HoracioDate
2021Center/Dept./Entity
Universidade da Coruña. Facultade de InformáticaDescription
Traballo fin de mestrado (UDC.INF). Bioinformática para as Ciencias da Saúde. Curso 2020/2021Abstract
[Resumen] Las nuevas técnicas de secuenciacón permiten la identificación de una gran cantidad de polimorfismos de un único nucleótido (SNPs), que pueden ser empleados para detectar el grado de variación en una muestra de individuos y aplicarse a estudios poblacionales. En este trabajo se analizaron 90 individuos del lacértido Iberolacerta monticola de la población presente en la ZEC Betanzos-Mandeo. Se empleó el pipeline de STACKS para obtener, a partir de las lecturas procesadas, un catálogo de loci, genotipar todos los individuos y llevar a cabo el análisis genético de la población. Previamente a la ejecución, se realizó una exploración del espacio paramétrico. Además, se elaboró una lista negra de loci para poder restringir los análisis poblacionales a loci autosómicos. El estudio concluye con la determinación de la estructura genética de la población, que permitió observar el grado de fragmentación y detectar barreras que pueden estar afectando a la supervivencia de la misma.
Keywords
Estructura genética poblacional
Lacértidos
MobiSeq
SNPs
STACKS
Lacértidos
MobiSeq
SNPs
STACKS
Rights
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