Population genetic, phylogenetic and sex-relatd gene expression analyses in two "Palaemon" species
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http://hdl.handle.net/2183/26917Coleccións
- Teses de doutoramento [2092]
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Population genetic, phylogenetic and sex-relatd gene expression analyses in two "Palaemon" speciesAutor(es)
Director(es)
González-Tizón, Ana M.Martínez-Lage, Andrés
Data
2020Resumo
[Abstract]
The rockpool shrimp Palaemon elegans and the common littoral shrimp P. serratus are two
ecologically important crustacean species on European coastlines. Palaemon serratus is
also an economically relevant resource, since it is considered a prized delicacy in European
markets. This PhD thesis aims to contribute to the understanding of the population and
reproductive biology of P. elegans and P. serratus by investigating the underlying genetics.
Firstly, a phylogeographic analysis was carried out in P. elegans using twenty-one newly
developed microsatellite loci. A Mediterranean sympatric cryptic species was revealed,
while genetic differentiation was detected in P. elegans sensu stricto across the
Atlantic-Mediterranean transition area, with the Almería-Orán Front as biogeographical
barrier. Secondly, seven Palaemon mitochondrial genomes, including those of P. elegans
and P. serratus, were described and used to conduct phylogenetic analyses. The cryptic
species within P. elegans was confirmed, and the Messinian Salinity Crisis was disclosed
as its origin. Furthermore, we proposed that the Atlantic and Mediterranean lineages of
P. serratus could actually be two separated species. Finally, a gonadal reference
transcriptome of P. serratus was de novo assembled and annotated. The first findings on
sex-related genes were reported, providing new insights into the sexual development of
this commercial species. [Resumen]
El camarón de roca Palaemon elegans y el camarón común P. serratus son crustáceos
ecológicamente importantes en las costas europeas. Palaemon serratus es también
económicamente importante al considerarse una apreciada delicia en los mercados
europeos. Esta tesis doctoral pretende ampliar el conocimiento de la biología poblacional y
reproductiva de P. elegans y P. serratus investigando diferentes aspectos de la genética
subyacente. En primer lugar, se realizó un análisis filogeográfico en P. elegans con
veintiún marcadores microsatélite nuevamente desarrollados. Se encontró una especie
críptica y mediterránea, así como diferenciación genética en P. elegans sensu stricto a
través de la transición Atlántico-Mediterráneo, con el Frente Almería-Orán como barrera
biogeográfica. En segundo lugar, se describieron siete genomas mitocondriales de Palaemon, incluyendo los de P. elegans y P. serratus, con los que se realizaron análisis
filogenéticos. Se confirmó la especie críptica de P. elegans y se determinó su origen en la
Crisis Salina del Messiniense. Además, se propuso que los linajes atlántico y mediterráneo
de P. serratus son realmente dos especies. Finalmente, se analizó de novo el transcriptoma
gonadal de P. serratus, aportándose los primeros hallazgos sobre genes relacionados con el
sexo y proporcionando nueva información sobre el desarrollo sexual de esta especie
comercial. [Resumo]
O camarón de roca Palaemon elegans e o camarón común P. serratus son crustáceos
ecoloxicamente importantes nas costas europeas. Palaemon serratus é tamén
economicamente importante ao considerarse unha prezada delicia nos mercados europeos.
Esta tese de doutoramento pretende ampliar o coñecemento da bioloxía poboacional e
reprodutiva de P. elegans e P. serratus investigando diferentes aspectos da xenética
subxacente. En primeiro lugar, realizouse unha análise filoxeográfica en P. elegans con
vinte e un marcadores microsatélite novamente desenvolvidos. Atopouse unha especie
críptica mediterránea e simpátrica, así como diferenciación xenética en P. elegans sensu
stricto a través da transición Atlántico-Mediterráneo, coa Fronte Almería-Orán coma
barreira bioxeográfica. En segundo lugar, describíronse sete xenomas mitocondriais de
Palaemon, incluídos os de P. elegans e P. serratus, e leváronse a cabo análises
filoxenéticas empregándoos. Confirmouse a especie críptica de P. elegans e a súa orixe
fixouse na Crise Salina do Messiniense. Ademais propúxose que as liñaxes atlántica e
mediterránea de P. serratus sexan realmente dúas especies distintas. Finalmente,
analizouse de novo o transcriptoma das gónadas de P. serratus, proporcionando os
primeiros achados de xenes relacionados co sexo e ampliando a información sobre o
desenvolvemento sexual desta especie comercial.
Palabras chave
Palemónidos-Genética
Variabilidad genética
Camarones-Poblaciones-Genética
Variabilidad genética
Camarones-Poblaciones-Genética
Descrición
Programa Oficial de Doutoramento en Bioloxía Celular e Molecular . 5004V01
Dereitos
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