Secuenciación parcial del genoma mitocondrial del cluster buzzatii de Drosophila

Abstract

[Resumen] En una tesis doctoral desarrollada por Luís Rodríguez López (2015) se cruzaron recíprocamente dos cepas diferentes de Drosophila buzzatii. La distribución sexual de la descendencia muestra evidencia inviabilidad parcial de los machos en uno de los dos sentidos de cruzamiento, debido posiblemente a un efecto materno asociado a la transmisión de una variante mitocondrial. En el presente proyecto se amplificó, secuenció y analizó una región determinada de genoma mitocondrial procedente de cada linaje. Contiene parte de los genes ND4 y CYTB, los genes completos ND4L y ND6, y las secuencias tRNA-thr y tRNA-pro. Se pretendía con su análisis la aproximación al origen de las diferencias del genoma mitocondrial causantes de esa inviabilidad, ya sea descartando o hallando distancias nucleotídicas en el fragmento escogido. La región de estudio también se comparó entre las especies del cluster Drosophila buzzatii. Se obtuvo así evidencia definitiva de que el genoma mitocondrial de una de las cepas utilizadas en la tesis doctoral anteriormente mencionada se corresponde con el de la especie D. koepferae. Revisando bibliográficamente su procedencia se sabe que en el origen de dicha cepa hay un cruzamiento de hembras de la especie D. koepferae con machos de la especie D. buzzatii. Se concluye entonces que las diferencias que se buscaban no obedecen a un polimorfismo nucleotídico de D. buzzatii, sino a que en uno de los linajes se heredó por vía materna el genoma mitocondrial de D. koepferae.

[Resumo] Nunha tese doutoral desenvolvida por Luís Rodríguez López (2015) cruzáronse recíprocamente dúas cepas diferentes de Drosophila buzzatii. A distribución sexual da descendencia mostra evidencias de inviabilidade parcial dos machos nun dos dous sentidos de cruzamento, debido posiblemente a efeccto materno asociado á transmisión dunha variante mitocondrial. No presente proxecto se amplificou, secuenciou e analizou unha rexión determinada de xenoma mitocondrial procedente de cada linaxe. Contén parte dos xenes ND4 e CYTB, os xenes completos ND4L e ND6, e as secuencias de ARNt-thr e ARNt pro. Preténdese coa súa análise a aproximación á orixe das diferenzas do xenoma mitocondrial causantes desta inviabilidade, xa sexa descartando ou atopando diferenzas nucleotídicas no fragmento escollido. A rexión de estudo tamén comparou entre as especies do clúster Drosophila buzzatii. Obtivose así evidencia definitiva de que o xenoma mitocondrial dunha das cepas utilizadas na tese doutoral anteriormente mencionada se corresponde co da especie D. koepferae. Revisando bibliográficamente a súa procedencia se sabe que na orixe de dita cepa hai un cruzamento de hembras da especie D. koepferae con machos da especie D. buzzatii. Conclúese entón que as diferenzas que se buscan non obedecen a un polimorfismo nucleotídico de D. buzzatii, senón a que nunha das liñas herdouse por vía materna o xenoma mitocondrial de D. koepferae.

[Abstract] In a doctoral thesis written by Luis Rodriguez Lopez (2015), were reciprocally crossed two different Drosophila buzzatii strains. The sexual distribution of the offspring shows evidence of partial infeasibility of the males in one of the two crossing directions, possibly due to a maternal effect associated with the transmission of a mitochondrial variant. In the present project, a specific region of mitochondrial genome from each lineage has been amplified, sequenced and analyzed. It contains part of the ND4 and CYTB genes, the complete sequence of ND4L and ND6 genes, and the tRNA-thr and tRNA-pro sequences. Analysis intends to approximate the origin of the differences in the mitochondrial genome that caused this infeasibility, either by ruling out or finding nucleotide differences in the chosen fragment. The study region was also compared between the species in the Drosophila buzzatii cluster. Thus, it was obtained that mitochondrial genome of one of the strains used in the aforementioned doctoral thesis corresponds to that of the species D. koepferae. Bibliographically reviewing its provenance, it is known that at the origin of this strain there is a crossbreeding of females of the species D. koepferae with males of the species D. buzzatii. It was then concluded that differences were sought were not due to a D. Buzzatii’s nucleotide polymorphism, but rather that the mitochondrial genome of D. koepferae was inherited maternally in one of the lineages.