Estudio de un brote epidémico causado por distintas cepas de "Acinetobacter baumannii" multirresistente: estudio de la epidemicidad y virulencia

Abstract

[Resumen] El patógenos oportunista Acinetobacter baumannii es uno de los seis microorganismos multirresistentes que más preocupa en hospitales de todo el mundo. Esto es debido a su capacidad para persistir en ambientes extremos, ya que es capaz de sobrevivir en el ambiente hospitalario, y a su versatilidad genética, ya que tiene la capacidad para desarrollar mecanismos de resistencia a antibióticos y desinfectantes. Múltiples brotes hospitalarios producidos por cepas de A. baumannii multirresistentes han sido descritos en todos los continentes. El presente trabajo aborda el estudio de uno de los brotes más importantes de la historia producido por varias cepas de A. baumannii multirresistentes, que surgió en el Hospital 12 de Octubre de Madrid, durante los años 2006‐2008 y que afectó a 377 pacientes. La presente tesis doctoral está dividida en cuatro capítulos: En el capítulo 1 se presenta el estudio la epidemiología clínica y molecular de un brote hospitalario causado por varias cepas de A. baumannii multirresistentes portadoras de la β‐ lactamasa OXA‐24. En el capítulo 2 se describe el estudio del posible mecanismo de diseminación de la β‐ lactamasa OXA‐24 entre las distintas cepas de un mismo brote hospitalario. Además, se describió por primera vez una cepa de A. calcoaceticus productora de la β‐lactamasa OXA‐24. En el capítulo 3 se describe el genoma completo del clon mayoritario del brote hospitalario, la cepa de A. baumannii AbH12O‐A2 (código de acceso a GenBank: CP009534.1) Finalmente, en el capítulo 4, se describe la implicación de un sistema de dos componentes, el sistema AbFhaB/AbFhaC, perteneciente al sistema de secreción tipo V, en adherencia a células epiteliales humanas y en virulencia.

[Resumo] O patóxeno oportunista Acinetobacter baumannii é un dos seis microorganismos multirresistentes que máis preocupa nos hospitais de todo o mundo. Isto débese á súa capacidade para persistir en ambientes extremos, xa que ten a capacidade de sobrevivir no ambiente hospitalario, e á súa versatilidade xenética, xa que ten a capacidade para desenrolar mecanismos de resistencia a antibióticos e desinfectantes. Múltiples brotes hospitalarios producíronse por cepas de A. baumannii multirresistentes ao longo de tódolos continentes. A presente tese de doutoramento trata do estudo dun dos brotes máis longos da historia producido por varias cepas de A. baumannii multirresistentes, no Hospital 12 de Octubre de Madrid durante os anos 2006‐2008 e que afectou a 377 doentes. A presente tese doutoral divídese en catro capítulos: No capítulo 1, preséntase o estudo da epidemioloxía clínica e molecular dun brote hospitalario causado por varias cepas de A. baumannii multirresistentes portadoras da β‐ lactamasa OXA‐24. No capítulo 2, preséntase o estudo do posible mecanismo de diseminación da β‐ lactamasa OXA‐24 entre ás distintas cepas dun mesmo brote hospitalario. Ademáis, describiuse por primeira vez unha cepa de A. calcoaceticus productora desta β‐lactamasa OXA‐ 24. No capítulo 3, descríbese o xenoma completo do clon maioritario do brote hospitalario, a cepa de A. baumannii AbH12O‐A2 (código de acceso ao GenBank: CP009534.1) E, finalmente, no capítulo 4, descríbese a implicación dun sistema de dúas compoñentes, o sistema AbFhaB/AbFhaC, pertencente ao sistema de secreción tipo V, en adherencia a células epiteliais humanas e en virulencia.

[Abstract] Acinetobacter baumannii is an opportunistic pathogen belonging to the six multirresistant organisms of greatest concern in hospitals worldwide. This fact is due to its ability to persist in adverse environments being able to survive in the hospital settings, and to its genetic versatility, being able to develop resistance mechanisms to antibiotics and disinfectants. Multiple hospital outbreaks caused by multidrug‐resistant strains of A. baumannii have been described in all continents. This work is focused in the study of the largest outbreak produced by various multidrug‐resistant A. baumannii strains, which has emerged in the Hospital 12 de Octubre, Madrid, Spain, affecting 377 patients during the years 2006‐2008. The present work is divided into four chapters: In chapter 1, we studied the clinical and molecular epidemiology of the above mentioned hospital outbreak caused by various multidrug‐resistant A. baumannii strains harboring the β‐lactamase OXA‐24. In chapter 2, we described the possible spread mechanism for the β‐lactamase OXA‐24 among different strains during the hospital outbreak. Furthermore, the first A. calcoaceticus strain producing the β‐lactamase OXA‐24 was described. In chapter 3, we described the complete genome of the A. baumannii AbH12O‐A2 strain (GenBank accession code: CP009534.1), the main clone found in during the hospital outbreak. Finally, in Chapter 4, we studied the involvement of a two component system, AbFhaB/AbFhaC, belonging to the type V secretion system, in adherence to human epithelial cells and virulence.