Papel del ribosoma bacteriano en la respuesta al estrés: análisis proteómico de los efectos de la mutación 926 del ARNr 16S

Abstract

[Resumen] Se cree que el ribosoma podría desempeñar un papel esencial en la adaptación al estrés ambiental como un punto de control que detecta los cambios de temperatura y de nutrientes. Es por esta razón, que en investigaciones previas de este grupo se estudió el efecto de la mutación G926 a bajas temperaturas. Estas personas extrajeron como conclusiones de sus análisis que hay varios factores que participan en la fase estacionaria, y que desempeñan la adaptación a bajas temperaturas, que funcionan de manera deficiente en estos mutantes. Además, observaron la pérdida de resistencia a la Kasugamicina cuando los mutantes crecían en frío. Este trabajo tiene como objetivo la identificación de genes potencialmente implicados en el fenotipo cruzado de resistencia de las células con mutaciones en la posición 926 del ARNr 16S de Escherichia coli. Para lograr nuestra meta, realizamos diferentes análisis mediante el empleo de programas bioinformáticos (FunRich, Panther y String). Como resultado de estos estudios detectamos tres proteínas, codificadas por los genes rpoZ, smpB y selB, que creemos que podrían estar involucrados en el fenotipo cruzado de pérdida de resistencia por parte de los mutantes 926.[Abstract] It is thought that the ribosome has an essential role in the adaptation to the environmental stress as a control point which detect the changes of temperature and nutrients. It is for this reason that in previous investigations of this group was studied the effect of the mutation G926 at low temperatures. These people extracted as conclusions of their analysis that there are some factors that participate in the stationary phase, and which help to the adaptation at low temperatures, which act poorly in these mutants. Also, they noticed the loss of resistance to Kasugamycin when the mutants grew in cold. This work has the aim of identifying the potentially implicated genes in the cross-resistance phenotype of the cells with mutations in the position 926 of the Escherichia coli’s RNA 16S. To achieve our goal, we make different analysis with some bioinformatic programs (FunRich, Panther and String). As a result of these studies, we detected three proteins, coded by the genes rpoZ, smpB and selB, which we think are involved in the cross phenotype of loss of the resistance by the mutants 926.[Resumo] Crese que o ribosoma xoga un papel esencial na adaptación ao estrés ambiental como un punto de control que detecta cambios na temperatura e os nutrientes. É por esta razón que se estudou o efecto da mutación do G926 a baixas temperaturas en investigacións anteriores deste grupo. Estas persoas concluíron a partir das súas análises que hai varios factores implicados na fase estacionaria e que se adaptan ás baixas temperaturas, que funcionan mal nestes mutantes. Ademais, observaron a perda de resistencia á Kasugamicina cando os mutantes medraron ao frío. Este traballo pretende identificar xenes potencialmente implicados no fenotipo cruzado de resistencia das células con mutacións na posición 926 do ARNr de Escherichia coli 16S. Para acadar o noso obxectivo, realizamos diferentes análises empregando programas de 4 bioinformática (FunRich, Panther e String). Como resultado destes estudos detectamos tres proteínas, codificadas polos xenes rpoZ, smpB e selB, que cremos que poderían estar implicados no fenotipo cruzado da perda de resistencia polos 926 mutantes.