Acinetobacter baumannii in critically ill patients: Molecular epidemiology, clinical features and predictors of mortality

Abstract

[Abstract]Introduction: The main aim of this study was to assess changes in the epidemiology and clinical presentation of Acinetobacter baumannii over a 10-year period, as well as risk factors of mortality in infected patients.

Method: Prospective, multicentre, hospital-based cohort studies including critically ill patients with A. baumannii isolated from any clinical sample were included. These were divided into a first period ("2000 study") (one month), and a second period ("2010 study") (two months). Molecular typing was performed by REP-PCR, PFGE and MSLT. The primary endpoint was 30-day mortality.

Results: In 2000 and 2010, 103 and 108 patients were included, and the incidence of A. baumannii colonization/infection in the ICU decreased in 2010 (1.23 vs. 4.35 cases/1000 patient-days; p<0.0001). No differences were found in the colonization rates (44.3 vs. 38.6%) or infected patients (55.7 vs. 61.4%) in both periods. Overall, 30-day mortality was similar in both periods (29.1 vs. 27.8%). The rate of pneumonia increased from 46.2 in 2000 to 64.8% in 2010 (p<0.001). Performing MSLT, 18 different sequence types (ST) were identified (18 in 2000, 8 in 2010), but ST2 and ST79 were the predominant clones. ST2 isolates in the ICU increased from 53.4% in the year 2000 to 73.8% in 2010 (p=0.002). In patients with A. baumannii infection, the multivariate analysis identified appropriate antimicrobial therapy and ST79 clonal group as protective factors for mortality.

Conclusions: At 10 years of the first analysis, some variations have been observed in the epidemiology of A. baumannii in the ICU, with no changes in mortality. Epidemic ST79 clone seems to be associated with a better prognosis and adequate treatment is crucial in terms of survival.

[Resumen] Introducción. El principal objetivo fue evaluar los cambios en la epidemiología a lo largo de un periodo de 10 años, así como la presentación clínica y los factores predictores de mortalidad en los pacientes críticos infectados por Acinetobacter baumannii.

Método. Estudio de cohortes prospectivo y multicéntrico en el que se incluyeron pacientes críticos con A. baumannii aislado de cualquier muestra clínica. Se consideró un primer período («estudio de 2000») (un mes) y un segundo («estudio de 2010») (2 meses). La tipificación molecular se realizó mediante REP-PCR, PFGE y MSLT. La variable resultado primaria fue la mortalidad a los 30 días.

Resultados. En 2000 y 2010 se incluyeron 103 y 108 pacientes, respectivamente, y la incidencia de colonización/infección por A. baumannii en la UCI disminuyó en 2010 respecto al 2000 (1,23 vs. 4,35 casos/1.000 pacientes-días; p < 0,0001). No se encontraron diferencias en la tasa de colonización (44,3 vs. 38,6%) o infección (55,7 vs. 61,4%) en ambos periodos. En general, la mortalidad a los 30 días fue similar en ambos periodos (29,1 vs. 27,8%). La tasa de neumonía aumentó desde el 46,2% en 2000 al 64,8% en 2010 (p < 0,001). Mediante MSLT, se identificaron 18 tipos de secuencias diferentes (ST) (18 en 2000, 8 en 2010), pero ST2 y ST79 fueron los clones predominantes. La identificación de ST2 aumentó en la UCI desde el 53,4% en 2000 al 73,8% en 2010 (p = 0,002). En los pacientes infectados, el tratamiento antimicrobiano apropiado y el grupo clonal ST79 fueron factores protectores de mortalidad en el análisis multivariante.

Conclusiones. A los 10 años del primer análisis se han observado algunos cambios en la epidemiología de A. baumannii en la UCI, sin cambios en la mortalidad. El clon ST79 epidémico parece estar asociado con un mejor pronóstico, y el tratamiento adecuado es crucial en términos de supervivencia.