Análisis proteómico de la respuesta al tratamiento con Faricimab en pacientes con Degeneración Macular Asociada a la Edad

Abstract

[Resumen] La Degeneración Macular Asociada a la Edad (DMAE) es una de las principales causas del deterioro visual y pérdida grave de la visión. En este trabajo evaluamos el perfil proteómico en células mononucleares de sangre periférica (PBMCs) de pacientes con DMAE tratados con Faricimab, que no respondieron a un tratamiento previo con un medicamento anti-VEGF. El estudio fue realizado con muestras 24 muestras de sangre de 12 pacientes y nueve controles. La primera muestra se obtuvo durante la visita basal (Vista 1) y dos meses después de ser tratado con Faricimab (Visita 2). La preparación y procesamiento de las muestras sanguíneas fue realizada en una plataforma robotizada. La proteína total se preparó en modo de alto rendimiento y se analizó mediante proteómica cuantitativa de alta resolución en una plataforma de cromatografía líquida acoplada a espectrometría de masas (LC-MS/MS). Los datos crudos obtenidos fueron procesados mediante el software Spectronaut. Las proteínas de expresión diferencial (DEPs) se definieron en función del cambio de abundancia entre pacientes en la Visita 1 y pacientes en Visita 2; y en pacientes Controles y Visita 1. Se realizó un análisis de la red de interacción de proteínas y ontología génica en el programa STRING. Se depositaron los datos crudos en el repositorio de acceso abierto MassiVe para que, tras la publicación de los resultados, queden a disposición de la comunidad científica. Los datos preliminares sugieren que el tratamiento con Faricimab induce una modulación de proteínas relacionadas con la coagulación sanguínea y activación plaquetaria. Estos procesos están relacionados con la angiogénesis, lo que indica una posible reversión inicial de los procesos de neovascularización. En futuras investigaciones se profundizará en la búsqueda de proteínas con perfiles de expresión diferencial, identificándolas como potenciales biomarcadores y dianas terapéuticas. [Abstract] Age-related macular degeneration (AMD) is one of the main causes of visual impairment and severe vision loss. In this work we evaluated the proteomic profile in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from AMD patients treated with Faricimab, who did not respond to previous treatment with an anti-VEGF drug. The study was performed with blood samples from 31 patients and nine controls. The first sample was obtained during the baseline visit (Visit 1) and two months after being treated with Faricimab (Visit 2). The preparation and processing of the blood samples was performed on a robotic platform. Total protein was prepared in high-throughput mode and analyzed by high-resolution quantitative proteomics on a liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS/MS) platform. The raw data obtained were processed using Spectronaut software. Differentially expressed proteins (DEPs) were defined based on the change in abundance between patients at Visit 1 and patients at Visit 2; and in Control patients and Visit 1. A protein interaction network and gene ontology analysis were performed in the STRING program. Raw data were deposited in the open access repository MassiVe so that, after the results are published, they will be available to the scientific community. Preliminary data suggest that treatment with Faricimab induces a modulation of proteins related to blood coagulation and platelet activation. These processes are related to angiogenesis, indicating a possible initial reversal of neovascularization processes. Future research will further investigate the search for proteins with differential expression profiles, identifying them as potential biomarkers and therapeutic targets. [Resumo] A dexeneración macular relacionada coa idade (DMAE) é unha das principais causas de deterioro visual e perda grave da visión. Neste traballo avaliouse o perfil proteómico en células mononucleares de sangue periférico (PBMC) de pacientes con DMAE tratados con Faricimab, que non responderon ao tratamento previo cun fármaco anti-VEGF. O estudo realizouse con mostras de sangue de 31 pacientes e nove controis. A primeira mostra obtívose durante a visita de referencia (Visita 1) e dous meses despois de ser tratada con Faricimab (Visita 2). A preparación e procesamento das mostras de sangue realizouse nunha plataforma robótica. A proteína total preparouse en modo de alto rendemento e analizouse mediante proteómica cuantitativa de alta resolución nunha plataforma de cromatografía líquida-espectrometría de masas (LC-MS/MS) Os datos brutos obtidos foron procesados mediante o software Spectronaut. As proteínas expresadas de forma diferencial (DEP) foron definidas en función do cambio de abundancia entre os pacientes na Visita 1 e os pacientes na Visita 2; e en Pacientes Control e Visita 1. Realizouse unha rede de interacción de proteínas e análise de ontoloxía xenética no programa STRING. Os datos brutos foron depositados no repositorio de acceso aberto MassiVe para que, tras a publicación dos resultados, estean a disposición da comunidade científica. Os datos preliminares suxiren que o tratamento con Faricimab induce unha modulación das proteínas relacionadas coa coagulación sanguínea e coa activación plaquetaria. Estes procesos están relacionados coa anxioxénese, o que indica unha posible reversión inicial dos procesos de neovascularización. As futuras investigacións afondarán na busca de proteínas con perfís de expresión diferenciais, identificándoas como potenciais biomarcadores e dianas terapéuticas.