Análisis de la variación genómica y la evolución del grupo Fc1 de retrovirus endógenos humanos

Abstract

El grupo de retrovirus endógenos humanos ERV-Fc1 parece poseer ciertas peculiaridades frente a la mayoría de retrovirus endógenos. Destaca su alto grado de conservación y su origen a partir de una única y reciente integración en un ancestro común a gorila, chimpancé, bonobo y humano. En este estudio se llevó a cabo un análisis del grupo mediante la búsqueda de posibles inserciones en los genomas, así como la determinación de la integridad de sus regiones estructurales más importantes. Por otro lado, se trató de reconstruir la posible secuencia activa original y el tiempo evolutivo en el que la inserción podría haber tenido lugar. Además, se intentaron detectar posibles indicios de presiones selectivas purificadoras sobre el grupo, lo que podría demostrar que desempeñan alguna importante función en el genoma. Por último, se reconstruyó la filogenia de las secuencias completas y de las regiones individualmente, con la finalidad de determinar si el grupo sigue un patrón evolutivo que coincide con el conocido y detectar posibles casos de recombinación, transferencia horizontal o evolución en mosaico de sus regiones.