Análisis del ADN repetitivo del genoma del lacértido Iberolacerta monticola mediante Next Generation Sequencing

Abstract

[Resumen] Iberolacerta monticola es una de las especies pertenecientes a la familia Lacertidae, uno de los grupos de reptiles más diversos del Paleártico Occidental. Su composición de ADN satélite genómico ha sido estudiada con anterioridad mediante técnicas clásicas de análisis de estos elementos repetitivos, basadas en la restricción parcial del ADN genómico. El objetivo de este trabajo es estudiar con NGS y la herramienta RepeatExplorer2 la exactitud de los resultados obtenidos con los métodos clásicos. Los resultados demuestran la presencia de las familias de ADN satélite HindIII y TaqI, y además confirman la existencia de diferencias en las proporciones de las subfamilias I y II de HindIII en I. monticola. También se ha comprobado que este procedimiento permite la obtención de otras secuencias repetitivas de interés.

[Resumo] Iberolacerta monticola é unha das especies pertencentes á familia Lacertidae, un dos grupos de réptiles máis diversos do Paleártico Occidental. A súa composición de ADN satélite xenómico foi estudada con anterioridade mediante técnicas clásicas de análisis destos elementos repetitivos, basadas na restrición parcial do ADN xenómico. O obxectivo deste traballo é estudar con NGS e a ferramenta RepeatExplorer2 a exactitude dos resultados obtidos cos métodos clásicos. Os resultados demostran a presencia das familias de ADN satélite HindIII y TaqI, e ademáis confirman a existencia de diferencias nas proporcións das subfamilias I e II de HindIII en I. monticola. Tamén comprobouse que este procedemento permite a obtención de outras secuencias repetitivas de interese.

[Abstract] Iberolacerta monticola is one of the species belonging to the Lacertidae family, one of the most diverse groups of reptiles in the Western Palearctic. Its genomic satellite DNA composition has been previously studied using classical analysis techniques for these repetitive elements, based on partial restriction of genomic DNA. The objective of this work is to study with NGS and the RepeatExplorer2 tool that the results obtained with classical methods are valid. The results demonstrate the presence of the satellite DNA families HindIII and TaqI and confirm the existence of differences in the proportions of subfamilies I and II of HindIII in I. monticola. It has also been found that this procedure allows the obtaining of other repetitive sequences of interest.