Análisis de la variación genómica y la evolución del grupo Fc1 de retrovirus endógenos humanos
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http://hdl.handle.net/2183/13857Coleccións
- Bioloxía, Grao en [451]
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Análisis de la variación genómica y la evolución del grupo Fc1 de retrovirus endógenos humanosTítulo(s) alternativo(s)
Análise da variación xenómica e a evolución do grupo Fc1 de retrovirus endóxenos humanosAnalysis of genomic variation of the ERV-Fc1 group of human endogenous retroviruses
Autor(es)
Director(es)
Naveira Fachal, HoracioData
2014Centro/Dpto/Entidade
Universidade da Coruña. Facultade de CienciasDescrición
Traballo fin de grao (UDC.CIE). Bioloxía. Curso 2013/2014Resumo
El grupo de retrovirus endógenos humanos ERV-Fc1 parece poseer ciertas peculiaridades
frente a la mayoría de retrovirus endógenos. Destaca su alto grado de conservación y su
origen a partir de una única y reciente integración en un ancestro común a gorila, chimpancé,
bonobo y humano. En este estudio se llevó a cabo un análisis del grupo mediante la búsqueda
de posibles inserciones en los genomas, así como la determinación de la integridad de sus
regiones estructurales más importantes. Por otro lado, se trató de reconstruir la posible
secuencia activa original y el tiempo evolutivo en el que la inserción podría haber tenido lugar.
Además, se intentaron detectar posibles indicios de presiones selectivas purificadoras sobre el
grupo, lo que podría demostrar que desempeñan alguna importante función en el genoma.
Por último, se reconstruyó la filogenia de las secuencias completas y de las regiones
individualmente, con la finalidad de determinar si el grupo sigue un patrón evolutivo que
coincide con el conocido y detectar posibles casos de recombinación, transferencia horizontal
o evolución en mosaico de sus regiones.
Palabras chave
Variabilidad genética
Retrovirus
Retrovirus endógenos humanos
ERV-Fc1
Filogénesis
Retrovirus
Retrovirus endógenos humanos
ERV-Fc1
Filogénesis
Dereitos
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