RNA Binding Proteins in Breast, Colon, and Rectal Cancer: A Comprehensive Study on Their Influence on Disease Progression and Potential Clinical Applications

Abstract

[Abstract] Breast cancer (BC) and Colorectal adenocarcinoma (COREAD) are major health problems worldwide. While significant progress has been made in understanding their molecular subtypes and genetics, a cure remains elusive. An emerging area of interest is the role of RNA-binding proteins (RBPs) in the development and progression of these cancers. RBPs are critical regulators of every hallmark of cancer and could serve as sensitive biomarkers for diagnosis, prognosis, and potential targets. In COREAD, a multidata integration strategy identified putative roles of NOP56, RBM12, NAT10, FKBP1A, EMG1, and CSE1L in the progression of colon cancer (COAD) and rectal cancer (READ). FKBP1A, NOP56, and NAT10 mRNA expression may predict poor prognosis in COREAD and COAD patients. In BC, integrated in silico analyses of human RBPs in major cancer databases revealed five putative BC RBPs (PUF60, TFRC, KPNB1, NSF, and SF3A3) with robust oncogenic features. PUF60 and SF3A3 were identified as central elements of a spliceosome-related cluster involving RBPs and cancer driver genes (CDGs). RBPs hold significant potential as diagnostic, prognostic, and therapeutic targets in BC, COAD, and READ. Further research on these RBPs is crucial to unveil their molecular mechanisms, validate their clinical potential, and develop novel treatment strategies.

[Resumen] El cáncer de mama (BC, por sus siglas en inglés) y el adenocarcinoma colorrectal (COREAD, por sus siglas en inglés) son importantes problemas de salud a nivel mundial. Si bien se ha logrado un progreso significativo en la comprensión de sus subtipos moleculares y su genética, la cura sigue siendo difícil de alcanzar. Un área emergente de interés es el papel de las proteínas de unión al ARN (RBPs, por sus siglas en inglés) en el desarrollo y progresión de estos cánceres. Las RBPs son reguladoras críticas de todas las características del cáncer y podrían servir como biomarcadores sensibles para el diagnóstico, el pronóstico y dianas terapéuticas potenciales. En COREAD, una estrategia de integración de datos múltiples identificó roles putativos de NOP56, RBM12, NAT10, FKBP1A, EMG1 y CSE1L en la progresión del cáncer de colon (COAD, por sus siglas en inglés) y el cáncer de recto (READ, por sus siglas en inglés). La expresión del ARNm de FKBP1A, NOP56 y NAT10 puede predecir un mal pronóstico en pacientes con COREAD y COAD. En BC, los análisis in silico integrados de las RBPs en las principales bases de datos de cáncer revelaron cinco RBPs implicadas en BC (PUF60, TFRC, KPNB1, NSF y SF3A3) con características oncogénicas sólidas. PUF60 y SF3A3 se identificaron como elementos centrales de un grupo relacionado con espliceosoma que involucra RBPs y genes conductores del cáncer (CDG, por sus siglas en inglés). Las RBPs tienen un potencial significativo como dianas diagnósticas, pronósticas y terapéuticas en BC, COAD y READ. La investigación adicional sobre estas RBPs es crucial para revelar sus mecanismos moleculares, validar su potencial clínico y desarrollar nuevas estrategias de tratamiento.

[Resumo] O cancro de mama (BC, Breast Cancer em inglês) e o adenocarcinoma colorrectal (COREAD, Colorectal Adenocarcinoma em inglês) son problemas de saúde importantes a nivel mundial. Aínda que se logrou un progreso significativo na comprensión dos seus subtipos moleculares e a súa xenética, a cura segue sendo difícil de alcanzar. Unha área emerxente de interese é o papel das proteínas de unión ao ARN (RBPs, RNA-Binding Proteins en inglés) no desenvolvemento e progresión destes cancros. As RBPs son reguladoras críticas de todas as características do cancro e poderían servir como biomarcadores sensibles para o diagnóstico, o pronóstico e posibles dianas terapéuticas. En COREAD, unha estratexia de integración de datos múltiples identificou roles putativos de NOP56, RBM12, NAT10, FKBP1A, EMG1 e CSE1L na progresión do cancro de colon (COAD em inglês) e o cancro de recto (READ em inglês). A expresión do ARNm de FKBP1A, NOP56 e NAT10 pode predicir un mal pronóstico en pacientes con COREAD e COAD. En BC, os análises in silico integrados das RBPs nas principais bases de datos de cancro revelaron cinco RBPs implicadas en BC (PUF60, TFRC, KPNB1, NSF e SF3A3) con características oncogénicas sólidas. PUF60 e SF3A3 identificáronse como elementos centrais dun grupo relacionado co espliceosoma que involucra RBPs e xenes condutores do cancro (CDG em inglês). As RBPs teñen un potencial significativo como dianas diagnósticas, pronósticos e terapéuticas en BC, COAD e READ. A investigación adicional sobre estas RBPs é crucial para revelar os seus mecanismos moleculares, validar o seu potencial clínico e desenvolver novas estratexias de tratamento.