Detección automática de la enfermedad de Alzheimer a partir de imágenes OCT retinianas en ratones transgénicos PS19 tau

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http://hdl.handle.net/2183/33916Coleccións
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Detección automática de la enfermedad de Alzheimer a partir de imágenes OCT retinianas en ratones transgénicos PS19 tauAutor(es)
Director(es)
Moura, Joaquim deOrtega Hortas, Marcos
Data
2023Centro/Dpto/Entidade
Universidade da Coruña. Facultade de InformáticaDescrición
Traballo fin de grao (UDC.FIC). Ciencia e enxeñaría de datos. Curso 2022/2023Resumo
[Resumen]: La enfermedad de Alzheimer representa uno de los desafíos más apremiantes en el ámbito
médico y farmacológico actual. Identificar biomarcadores efectivos y desarrollar técnicas de
diagnóstico temprano son elementos clave para combatir esta epidemia silenciosa. En este
entorno, el presente Trabajo de Fin de Grado (TFG) explora un enfoque novedoso: el uso de
imágenes de tomografía de coherencia óptica (OCT) retinianas obtenidas de ratones transgénicos
PS19 tau. Estos ratones se caracterizan por su susceptibilidad a desarrollar sintomatología
similar a la del alzhéimer en humanos, lo que los convierte en modelos preclínicos ideales
para esta investigación.
Nuestro enfoque innovador emplea técnicas de aprendizaje profundo para construir un
sistema de segmentación automática tridimensional. Este sistema es capaz de extraer biomarcadores
retinianos críticos que pueden correlacionarse con el desarrollo de la enfermedad de
Alzheimer. Este conjunto de algoritmos forma parte de un pipeline de diagnóstico automatizado,
complementado por un modelo de clasificación específico para estos biomarcadores.
Los resultados iniciales son alentadores, mostrando un alto grado de precisión y validando
la aplicabilidad de nuestra metodología en entornos preclínicos y farmacológicos. Este
enfoque no solo mejora la velocidad y la eficacia del diagnóstico, sino que también reduce la
subjetividad y la variabilidad asociadas a la interpretación humana. El proyecto se desglosa
en dos fases fundamentales: la primera enfocada en la segmentación automática de imágenes
OCT para la identificación de biomarcadores relevantes, y la segunda en la clasificación
robusta de dichos biomarcadores para un diagnóstico preciso de la enfermedad de Alzheimer. [Abstract]: The Alzheimer’s disease represents one of the most pressing challenges in today’s medical
and pharmacological fields. Identifying effective biomarkers and developing early diagnosis
techniques are key elements in combating this silent epidemic. Within this context, the
present Thesis explores a novel approach: the use of Optical Coherence Tomography (OCT)
retinal images obtained from PS19 tau transgenic mice. These mice are characterized by their
susceptibility to develop symptoms similar to Alzheimer’s in humans, making them ideal preclinical
models for this research.
Our innovative approach employs deep learning techniques to build a three-dimensional
automatic segmentation system. This system is capable of extracting critical retinal biomarkers
that can be correlated with the development of Alzheimer’s disease. This set of algorithms
forms part of an automated diagnostic pipeline, complemented by a specific classification
model for these biomarkers.
The initial results are encouraging, showing a high degree of accuracy and validating the
applicability of our methodology in preclinical and pharmacological settings. This approach
not only improves the speed and efficacy of the diagnosis but also reduces the subjectivity
and variability associated with human interpretation. The project is broken down into two
fundamental phases: the first focuses on the automatic segmentation of OCT images for the
identification of relevant biomarkers, and the second on the robust classification of these
biomarkers for an accurate diagnosis of Alzheimer’s disease.
Palabras chave
Aprendizaje profundo
Neuro-oftalmología
Retina
Tomografía de coherencia óptica
Visión por computador
Segmentación de imágenes
Clasificación de marcadores
Ratones transgénicos PS19 tau
Enfermedad de Alzheimer
Deep learning
Neuro-ophthalmology
Optical coherence tomography (OCT)
Computer vision
Image segmentation
Image classification
Tau transgenic PS19 mice
Alzheimer’s disease
Neuro-oftalmología
Retina
Tomografía de coherencia óptica
Visión por computador
Segmentación de imágenes
Clasificación de marcadores
Ratones transgénicos PS19 tau
Enfermedad de Alzheimer
Deep learning
Neuro-ophthalmology
Optical coherence tomography (OCT)
Computer vision
Image segmentation
Image classification
Tau transgenic PS19 mice
Alzheimer’s disease
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