Interactome of Ixr1, HMGB1 and HMGB2 proteins in relation to their cellular functions
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http://hdl.handle.net/2183/20216Colecciones
- Teses de doutoramento [2165]
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Interactome of Ixr1, HMGB1 and HMGB2 proteins in relation to their cellular functionsAutor(es)
Directores
Lamas Maceiras, MónicaCerdán, María Esperanza
Fecha
2017Centro/Dpto/Entidad
Universidade da Coruña. Departamento de Bioloxía Celular e MolecularResumen
[Abstract]The Saccharomyces cerevisiae protein, Ixr1, and human HMGB1 and HMGB2
proteins belong to the HMGB protein family. The main objective of this
work was to identify new proteins binding Ixr1, HMGB1 and HMGB2 in
order to increase the knowledge about their cellular functions.
In yeast Ixr1 has activator or repressor activity on transcription in different
promoters and controls the hypoxic response. The transcriptional activator
domain of Ixr1 has been identified in its NH2 term in this study. Interactome
studies show that Ixr1 binds to Ssn8 and this interaction might mediate the
repressor function of Ixr1 on several promoters. Other proteins identified
share functions associated to glucose metabolism, stress, and ribosome
biogenesis among others. Differential phosphorylation of Ixr1 was observed
depending on oxygen availability.
The HMGB1 and HMGB2 interactomes were studied using different
techniques as yeast two‐hybrid assays and purification methods coupled
with mass spectrometry. This study was carried out in cancerous and noncancerous
ovarian and prostate epithelial cells. Results showed the wide
range of functions linked to their interacting partners. The interaction of
HMGB1 with KRT7 and RBBP7 was validated by complementary techniques.
HMGB1 specific interactions associated to cisplatin treatment of these cells
were also identified in this study. [Resumen]
La proteína de Saccharomyces cerevisiae Ixr1, y las proteínas humanas
HMGB1 y HMGB2 se engloban dentro de la familia de proteínas HMGB. El
principal objetivo de este trabajo ha sido la identificación de proteínas no
previamente descritas que se unen a Ixr1, HMGB1 y HMGB2, para así poder
ampliar el conocimiento sobre las funciones celulares de las proteínas
HMGB.
En levaduras, Ixr1 tiene un papel activador o represor de la transcripción
sobre distintos promotores y controla la respuesta a hipoxia. El dominio de
activación transcripcional de Ixr1 ha sido localizado en su extremo amino
en este estudio. Ixr1 se une con Ssn8 y esta interacción puede mediar su
papel represor sobre los promotores de algunos genes. Ixr1 además
interacciona con proteínas relacionadas con el metabolismo de glucosa,
estrés y biogénesis de ribosomas entre otras. Se ha detectado que Ixr1
presenta una fosforilación diferencial en función de la disponibilidad de
oxígeno.
Se ha llevado a cabo un estudio del interactoma de HMGB1 y HMGB2
mediante técnicas como el sistema de doble híbrido o purificaciones
acopladas a espectrometría de masas en células epiteliales de ovario y
próstata tumorales y no tumorales. Los resultados obtenidos ponen de
manifiesto la amplia variedad de funciones asociadas a las proteínas que
interactúan con HMGB1 o HMGB2. Se ha validado la interacción de HMGB1
con KRT7 y RBBP7 mediante otras técnicas complementarias. Así como
también se han identificado interacciones específicas de HMGB1 en células
tratadas con cisplatino. [Resumo]
A proteína de Saccharomyces cerevisiae Ixr1, e as proteínas humanas
HMGB1 e HMGB2 englóbanse dentro da familia de proteínas HMGB. O
principal obxectivo deste traballo foi a identificación de proteínas non
previamente descritas que se unen a Ixr1, HMGB1 e HMGB2, para así poder
ampliar o coñecemento sobre as funcións celulares das proteínas HMGB.
En lévedos, Ixr1 ten un papel activador ou represor da transcrición sobre
distintos promotores e controla a resposta a hipoxia. O dominio de
activación transcripcional de Ixr1 foi localizado no seu extremo amino
neste estudo. Ixr1 únese con Ssn8 e esta interacción pode mediar o seu
papel represor sobre os promotores dalgúns xenes. Ixr1 ademais,
interacciona con proteínas relacionadas co metabolismo de glicosa, stress e
ribosomais entre outras. Detectouse que Ixr1 presenta unha fosforilación
diferencial en función da dispoñibilidade de osíxeno.
Levouse a cabo un estudo do interactoma de HMGB1 e HMGB2 mediante
técnicas como o sistema de dobre híbrido ou purificacións e espectrometría
de masas en células epiteliais de ovario e próstata tumorais e non tumorais.
Os resultados obtidos poñen de manifesto a ampla variedade de funcións
asociadas ás proteínas que interactúan con HMGB1 ou HMGB2. Hase
validado a interacción de HMGB1 con KRT7 e RBBP7 mediante outras
técnicas complementarias. Así como tamén se identificaron interaccións
específicas de HMGB1 en células tratadas con cisplatino
Palabras clave
Interacciones proteína-proteína
Proteínas HMGB
Biología molecular
Proteínas HMGB
Biología molecular
Descripción
Programa Oficial de Doutoramento en Bioloxía Celular e Molecular . 5004V01
Derechos
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