Evaluación de la diversidad genética y estructura poblacional del berberecho "Cerastoderma edule" mediante marcadores microsatélite y de ADN mitocondrial

Abstract

[Resumen]La conservación, gestión y comprensión de la biología evolutiva de una especie requiere conocer la variación genética existente y cómo se distribuye en las poblaciones. En esta tesis se analizó la variación genética del berberecho Cerastoderma edule, un componente importante del ecosistema costero y un recurso explotado en el litoral europeo, para progresar en la caracterización genética de las poblaciones naturales, tratando de reconocer factores históricos y contemporáneos que pudiesen influir en la distribución de su variación genética. Mediante la construcción de una genoteca enriquecida en secuencias microsatélite se desarrolló el primer panel de marcadores microsatélite en esta especie, optimizándose dos PCRs multiplex para facilitar su análisis. Ello ha permitido aportar las primeras estimas de diversidad genética para la región noroeste de la Península Ibérica, sometida a una intensa explotación, evaluar la estructura de población y proponer las causas de la diferenciación poblacional detectada. Por otra parte, se evaluó la diversidad genética y estructura poblacional a lo largo del ámbito de distribución de la especie y se examinó su historia evolutiva, contrastando los datos genéticos proporcionados por marcadores microsatélite y el gen mitocondrial citocromo b, lo cual ha llevado a identificar tres grupos de poblaciones con signos de patrones evolutivos diferentes.

[Resumo]A conservación, xestión e comprensión da bioloxía evolutiva dunha especie require coñecer a variación xenética existente e cómo se distribúe nas poboacións. Nesta tese analizouse a variación xenética do berberecho Cerastoderma edule, un compoñente importante do ecosistema costeiro e un recurso explotado no litoral europeo, para progresar na caracterización xenética das poboacións naturais, tratando de recoñecer factores históricos e contemporáneos que puidesen influír na distribución da súa variación xenética. Mediante a construción dunha xenoteca enriquecida en secuencias microsatélite desenvolveuse o primeiro panel de marcadores microsatélite nesta especie, optimizándose dúas PCRs multiplex para facilitar a súa análise. Isto permitiu aportar as primeiras estimas de diversidade xenética para a rexión noroeste da Península Ibérica, sometida a unha intensa explotación, avaliar a estrutura de poboación e propoñer as causas da diferenciación poboacional detectada. Por outra parte, avaliouse a diversidade xenética e estrutura poboacional ó longo do ámbito de distribución da especie e examinouse a súa historia evolutiva, contrastando os datos xenéticos proporcionados por marcadores microsatélite e o xene mitocondrial citocromo b, o que levou a identificar tres grupos de poboacións con signos de patróns evolutivos diferentes.

[Abstract] The conservation, management and understanding of the evolutionary biology of a species require knowing genetic variation and how it is distributed in populations. This work analyzes the genetic variation in the cockle Cerastoderma edule, an important member of the coastal ecosystem and an exploited resource in the European littoral, in order to improve the genetic characterization of natural populations, trying to recognize historical and contemporary factors that might have influenced the distribution of its genetic variation. A microsatellite enriched library was constructed to develop the first set of microsatellite markers and two multiplex PCRs were opimized for ease of analysis. This allowed us to provide the first estimates of genetic diversity in the northwestern Iberian Peninsula, an area under intense exploitation, to evaluate the population structure and to propose the causes of the genetic differentiation detected. Moreover, genetic diversity and population structure throughout the distribution range of the species were assessed and the evolutionary history examined, contrasting genetic data provided by microsatellite markers and the cytochrome b gene. This led to the identification of three groups of populations with signs of different evolutionary.